羊粪有机肥料中的有益微生物还能抑制有害病菌、有害生物的繁殖。同时，羊粪有机肥料中有动物消化道分泌的各种活性酶，以及微生物产生的各种酶。这些物质施到土壤后，可大大提高土壤的酶活性。长期持久使用有机肥可以改善土壤的质量。
 提供农作物所需营养，保护农作物根茎
羊粪有机肥料中含有植物所需要的大量营养成分及微量元素等。且羊粪有机肥料分解释放的二氧化碳可作为植物光合作用的材料。
羊粪有机肥料中还含有氮、磷、钾三种元素，可为农作物提供全面的营养。同时，羊粪有机肥料在土壤中分解，能够转化形成各种腐殖酸，腐殖酸是一种高分子物质，具有很好的吸附性能，对重金属离子有很好的吸附作用，能有效地减轻重金属离子对农作物的危害，并阻止其进入植株中，并且保护植物的根茎。
 增强农作物抗病、抗旱、耐涝能力
羊粪有机肥料可增强农作物抗病性，减轻或防止病害发生。羊粪有机肥料施入土壤后，可增强土壤的蓄水保水能力，在干旱情况下，能增强作物的抗旱能力。同时，羊粪有机肥料还可使土壤变得疏松，改善作物根系的生态环境，促进根系的生长，增强根系活力，提高作物耐涝能力，减少植物的死亡率，提高了农产品的生存率。
 提高食品的安全性
农业生产过程必须尽量限制无机肥料的过量使用，有机肥料才是生产绿色食品的主要肥源。由于羊粪有机肥料中各种营养元素比较完全，而且这些物质完全是无毒、无害、无污染的自然物质，这就为生产高产、优质、无污染的绿色食品提供了必须条件。