羊粪有机肥料中的有益微生物还能抑制有害病菌、有害生物的繁殖。同时，羊粪有机肥料中有动物消化道分泌的各种活性酶，以及微生物产生的各种酶。这些物质施到土壤后，可大大提高土壤的酶活性。长期持久使用有机肥可以改善土壤的质量。
 提供农作物所需营养，保护农作物根茎
①羊粪有机肥料中含有植物所需要的大量营养成分及微量元素等。且羊粪有机肥料分解释放的二氧化碳可作为植物光合作用的材料。
②羊粪有机肥料中还含有氮、磷、钾三种元素，可为农作物提供全面的营养。同时，羊粪有机肥料在土壤中分解，能够转化形成各种腐殖酸，腐殖酸是一种高分子物质，具有很好的吸附性能，对重金属离子有很好的吸附作用，能有效地减轻重金属离子对农作物的危害，并阻止其进入植株中，并且保护植物的根茎。